95 trauksmaini gadi aizritējuši kopš 1930. gada 1. septembra rīta, kad vistālākajā Svētes pagasta nostūrī, aiz Svētes upes, pie Tušķiem, jauns un darbīgs skolotājs Fricis Jorniņš sapulcināja 22 bērnus, kuri uzsāka mācības jaundibinātās četrgadīgās pamatskolas 1. un 2. klasē.

Patiesībā, skolas vēsture aizsākās vēl 2 gadus pirms tam - 1928. gadā, kad Tušķu apkārtējo māju saimnieki sāka vākt ziedojumus skolas celtniecībai: Jelgavas apriņķa valde viņu iniciatīvu būvēt pamatskolu gan atbalstīja, taču solīja dot vien nelielu daļu no tam nepieciešamajiem līdzekļiem. Pēc arhitekta Zēberga projekta, 1929. gadā uzsāk skolas ēkas celtniecību. Būvdarbus pabeidza tikai pēc pieciem gadiem, tāpēc sākumā mācības notika skolas pārziņa un vienīgā mācībspēka Friča Jorniņa dzīvokļa lielākajā istabā.

1932. gadā skolu nosauc par Svētes-Aizupes I pakāpes pamatskolu. Šajā gadā darbojās jau 4 klases ar 35 skolēniem. Kā palīgskolotāja sāk strādāt Vanda Kipere, kura 1934. gada rudenī kļuva par nākošo skolas direktori, amatā strādājot līdz 1953. gadam.

1947./48. mācību gadā skolu beidz pirmais 7-gadīgās skolas izlaidums - 13 skolēni. Skolā strādā 6 skolotaji.

No 1953. gada skolu īsi brīdi vada skolotāja Ejupe, ar 2. pusgadu - V. Fadejevs, kurš amatā ir līdz 1957. gadam. Skolā darbojās pionieru un oktobrēnu grupas. Kolektīvs piedalās ražas novākšanas talkās.

1955.-1957. g. par skolas mācību pārzini strādā skolotaja H. Mirska.

1957.-1982. g. par skolas direktori strādā Mirdza Blūma. 1961. gadā sākas skolas ēkas piebūves celtniecība un vecās skolas ēkas rekonstrukcija. 1961. gadā skolā sāk mācibas pirmā 8. klase ar 17 bērniem. Skolēniem jāsaspiežas, jo reizē notiek būvdarbi, kuros piedalās arī skolēni un skolotaji. Ar 1963./64. m.g. 150-160 skolēni jau mācās jaunajā ēkā. Skolai tiek pasniegts skolas karogs. Veiksmīgi darbojas deju kolektīvs un dramatiskais kolektīvs. 1971./72. mācību gadā, kā mācību daļas vadītāja, darbu uzsāk L. Šulmane. Skola pāriet uz kabinetu sistēmu un skolas metodiskais kabinets ir labākais rajonā. Notiek 6-gadīgo bērnu apmācība, lekcijas vecākiem, skolā organizē konkursus par labākajām sekmēm, disciplīnu, praktiskā darba iemaņām. Skolā darbojas zīmēšanas, aušanas, literārās jaunrades un citi pulciņi.

1982.-1999. g. skolu vada direktore Vera Juhņēviča. Skola aktīvi sadarbojas ar bērnu vecākiem, skolas šefiem. Par mācību pārzini strādā V. Račiņa, vēlāk R. Kļaviņa un I. Zabolotnaja. Rosīgi strādā skolēnu pašpārvalde. Gaiteņos izvieto skolēnu labākos zīmējumus, sasniegumus. Skola ir vien no pirmajām Jelgavas rajonā, kas pāriet uz 40 minūšu mācību stundu, 10 baļļu vērtēšanas sistēmu un ievieš ieskaišu sistēmu. Skolai ir labi sasniegumi rajona olimpiādēs.

1992. gadā skolā mācījās 249 skolēni un strādāja 25 skolotāji. Darboijās 11 pulciņu un fakultatīvi. 1995. gadā, par godu skolas 65 gadu jubilejai, dzejniece Dina Bitēna Sirmā un komponists Atvars Sirmais uzraksta Aizupes pamatskolas himnu.

1999.-2008. g. skolas direktore ir Klāra Stepanova. Daudz darīts skolas un tās teritorijas labiekārtošanā un estētiskā tēla veidošanā: nomainīta zāles grīda, ielikti jauni logi, izveidotas divas datorklases telpas, aiz zāles ierīkotas meiteņu un zēnu ģērbtuves un dušas telpas, ierīkots futbola laukums. Aiz skolas izveidots rotaļu laukums ar koka konstrukcijām 5-6 gadīgajiem bērniem un sākumskolas bērniem skolēniem. Skolas pagalms iegūst jaunu seju: zāliens, bruģēti celiņi, strūklaka "Staburags", soliņi. Par tradīciju kļūst 9. klašu Žetona vakars. Mācību pārzine Irina Lapiņa un vadības komanda izstrādā vairākus nolikumus: pedagoģiskās padomes, metodiskās padomes un komisijas, skolas padomes, bibliotēkas, skolēnu līdzpārvaldes, projekta nedēļas u.c.. 2004. gada akreditācijā slavē vadītāju un skolotāju darbu, sadarbību ar vecākiem un Līvbērzes pagastu. 2005./06. m.g. ievieš jauno pamatizglītības standartu. Par īpašiem panākumiem ilgtspējīgas attīstības, vides izglītibas un aizsardzības veicināšanā, 2007. gadā Aizupes pamatskola iegūst starptautisko Ekoskolas nosaukumu un simbolisko Zaļo karogu. Toreizējais vides ministrs Raimonds Vējonis viesojas skolā un paceļ karogu.

2008.-2010. g. skolas direktore ir Inga Jansone. Darbu sāk mācību pārzine Dace Hercberga. Skolas teritorijā tiek īstenots apgaismojuma projekts. Skolā viesojas Renārs Kaupers. 2010./11. m.g. skolā iet 225 skolēni un strādā 21 pedagogs, kurus atbalsta 10 tehniskie darbinieki.

2011.-2021. g. skolas direktore ir Zane Lange. 2016.-2018. g. direktores pienākumus uz laiku pildīja Ināra Eliņa. Skola turpina iesaistīties starptautiskā sadarbībā piedaloties dažādos projektos.

2022.-Mūsdienas. Aizupes pamatskolas direktores amatu ieņem Amanda Siliņa. Tiek izstrādāta kārtība skolēnu uzņemšanai 1. klasē. Skola turpina attīstīties metodiskajā darbā. 2024/25. m.g. uzsāk 242 skolēni.